逆转录酶是以RNA为模板指导三磷酸脱氧核苷酸合成互补DNA的酶，哺乳类C型病毒的反转录酶和鼠类B型病毒的反转录酶都是一条多肽链，鸟类RNA病毒的反转录酶则由两上亚基结构，真核生物中也都分离出具有不同结构的反转录酶。

一般来说不同生物分离出的反转录酶具有不同结构，其中大部分是蛋白质或其亚结构如多肽，有一种比较重要的逆转录酶为端粒酶，是个由RNA和蛋白质组成的核糖核酸蛋白复合物，其RNA组分为模板，蛋白组分具有催化活性，以端粒3末端为引物，合成端粒重复序列。