都指挥使司是中国明朝设立于地方的军事指挥机关。

明初，废元枢密、平章、元帅、总管、万户诸武官号，统兵五千人者授指挥，以下千户、百户、总旗、小旗不等。度山川形势，分设卫所。大致五千六百人为卫、千人为千户所、百人为百户所，官兵均世籍。

洪武三年，升杭州等八卫为都卫。五年，设亲王护卫指挥使司，统诸王府护卫。八年，改在京留守都卫为留守卫指挥使司，诸外都卫为都指挥使司，初设十三都指挥使司。洪武二十六年定天下都司卫所，共计都司十七，留守司一，内外卫三百二十九，守御千户所六十五。其后沿革， 都指挥使