区别如下：

1、性质不同：毕业论文是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。学年论文是高等学校人文科学，自然科学，社会科学及师范类专业本科学生在教学计划规定的某一学期内，在教师指导下就给定的课题独立进行研究所写出的小论文。

2、要求不同：学年论文应注意主题明确，结构合理，语言流畅。毕业论文须在教师指导下，选定课题进行研究，撰写并提交论文。

3、写作的手法不同：一般的论文需要查阅大量的相关资料和文献，综述前人的研究成果，陈述别人的观点，然后另辟新意，提出一个新的论点和理论，最后还需要做大量的实地研究和调查问卷。学年论文附表的表头应写在表的上面，居中，附图的图题应写在图的下面，居中。按表，图，公式在论文中出现的先后顺序分别编号。