三清祖师爷分别指玉清元始天尊，上清灵宝天尊和太清道德天尊。在三清大殿内，元始天尊位居中央，手执玄珠，左手虚拈或虚捧，象征天地未形、万物未生、清浊未判、阴阳未分、混沌之时的“无极”状态，即宇宙形成的第一大世纪。玉清元始天尊的圣诞日为“冬至”日。灵宝天尊位居左位，手执太极图或玉如意，象征混沌始辨、清浊剖判、阴阳初分的“太极”状态，即宇宙形成的第二大世纪。上清灵宝天尊的圣诞日为“夏至”日。道德天尊位居右位，手执太极神扇，俯视世间万事万物，象征万物化生的“太初”状态，即宇宙形成的第三大世纪，太清道德天尊的圣诞日为农历的“二月十五日”。