奈克瑟斯里面总共有4个黑暗奥特曼，分别为黑暗浮士德，黑暗梅菲斯特，黑暗梅菲斯特二代和黑暗扎基。

浮士德最初出现在第7集，之后在12集为了保护孤门而被异生兽重伤最后死亡。黑暗梅菲斯特首次出现在14集，之后在24集和奈克瑟斯一同消失在光芒中。二代在32集里面出现，与重伤的梅菲斯特大战，最后梅菲斯特用身体封住了二代的行动，奈克瑟斯乘机***死了二代，梅菲斯特也因为重伤而死亡。最后的黑暗扎基在最后一集里面出现，被奈克瑟斯超进化后的诺亚连环攻击，最后被***死。