1、光镜的光源来自太阳光，而电镜的光源来自电子光束。且二者的放大倍数也有区别，电镜比光镜倍数更大，能看到的东西更加细致，电镜和光镜相比互有优劣。

2、虽然光镜看起来比不上电镜，但是光镜因为借用的自然光，所以对于观察的样品损伤更小。而且电镜只能看到黑白的影像，无法像光镜一样对样品进行染色。