主任科员属于正科级的非领导职务，职责略低于科长、乡长、镇长等领导职务的正科级领导职务，享受正科级待遇，主任科员是正科级职务下的一个领导名称。

公务员职务分类

领导职务层次分为：标准正职、标准副职、省部级正职、省部级副职、厅局级正职、厅局级副职、县处级正职、县处级副职、乡科级正职、乡科级副职。

非领导职务层次在厅局级以下设置。综合管理类的领导职务根据宪法、有关法律、职务层次和机构规格设置确定。综合管理类的非领导职务分为：巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员、科员、办事员。综合管理类以外其他职位类别公务员的职务序列，根据本法由国家另行规定。