区别在于指向不同，意思不同等，小妹是指自己的最小的妹妹，而小妹妹是泛指一般称呼的小姑娘，小妹妹的意思，二者有区别的

这两种称呼是不同关系的体现。小妹，是称呼直系的妹妹或近亲的妹妹。关系极好的也可以称呼朋友。而小妹妹，则是官称。有尊重的成分也显得亲切。但关系只是偶遇或并不相识。

小妹和小妹妹虽然指的都是比自己年龄小的女性，但二者称呼还是有差别。小妹的称呼应用更多，男性对小女生的普遍称呼，如果叫小妹妹，表达的亲昵、爱护的意味更多，说明男性对女性的喜爱。

根据常规的理解，"小妹"和"小妹妹"都可以用来称呼年幼的女孩，但两者有一些微小的区别。

"小妹"一般是用来称呼比自己年幼的女孩，可以是妹妹的亲戚、朋友或其他人。例如，一个姐姐可以称呼自己的妹妹为"小妹"。这个称呼更多的是用在亲近的关系中，比较亲昵。

"小妹妹"通常是用来称呼与自己没有亲属关系的年幼女孩。这个称呼更多的是用在非亲属、不太熟悉的关系中，比较客观和礼貌。

需要注意的是，这种称呼在不同地区和不同语境下可能有一些差异。具体使用哪个称呼要根据具体情况和个人偏好来决定。