武汉工程大学的学费因专业不同而有所差异。例如，土木工程、化学工程与工艺、应用化学、光电信息科学与工程、环境工程、软件工程、能源与动力工程等专业的学费为4500元/年。而高分子材料与工程、通信工程等专业的学费为5850元/年。另外，化学工程与工艺（中外合作办学）专业的学费为25000元/年。