NTFS提供长文件名，压缩分区，事件跟踪，文件索引，高容错，数据保护和恢复以及加密访问。exFAT文件系统不能。

NTFS文件系统格式仅适用于Microsoft计算机操作系统。它不适用于Apple操作系统;exFAT文件系统格式适用于Microsoft计算机操作系统和Apple操作系统。

exFAT访问速度将根据文件减少到不同程度，NTFS不会。兼容性，exFAT支持各种可移动存储卡和闪存驱动器。

exFAT文件是Microsoft创建的一种新文件格式，用于替换FAT32文件格式。它可以支持高达1EB的文件大小，非常适合存储大文件，并且可以在Mac和Windows操作系统上使用。