杆状，末端圆。单个或呈短链排列，1.2到1.5乘以2.0到4.0微米，能运动，革兰氏阳性。芽孢1.0到1.2乘以1.5到2.0微米，椭圆形，中生或次端生。液化明胶慢、胨化牛奶、水解淀粉、不还原硝酸。 巨大芽孢杆菌为产孢杆菌，且为革兰氏阳性菌及好氧菌，也为常见的油中腐生菌。通过比较巨大芽孢杆菌和拮抗菌的芽孢形成率，从而确定了兰花炭疽病拮抗菌。