南开大学医学院于1988年筹办、1989年招生、1993年经原国家教委批准正式成立，现位于南开大学历史最悠久的建筑思源堂。

学院旨在培养医德高尚，人文和自然科学基础知识宽厚、医学基础理论扎实、专业实践技能熟练，具有终生自我充实能力的高级医学专门人才。有天津市“模式动物与退行性神经系统疾病”重点实验室。

含有临床医学博士学位授权一级学科。

生物医学工程、临床医学、基础医学、口腔医学4个硕士学位授权一级学科。

生物医学工程、 生理学、 人体解剖与组织胚胎学、免疫学、内科学、外科学、儿科学、影像医学与核医学、妇产科学、耳鼻咽喉科学、口腔临床医学11个硕士学位授权二级学科。