东南大学建筑学院前身为原国立中央大学建筑系，创立于1927年，是中国现代建筑学学科的发源地。1952年全国高校院系调整后成为南京工学院建筑系，1988年随学校复更名为东南大学建筑系，2003年组建为东南大学建筑学院。

学院下设三个系和四个研究所，即建筑系、城乡规划系、风景园林系、建筑历史与理论研究所、建筑科学与技术研究所、美术与设计研究所、建筑运算与应用研究所。东南大学建筑学院是全国高等院校建筑学学科专业指导委员会历届主任挂靠单位。