大蛇丸在佐助与鼬一战中被鼬的十拳剑封印。后在第四次忍界大战中，佐助、重吾、水月将大蛇丸从御手洗红豆的咒印中复活，并从兜身上取回了自己的查克拉以及兜在这期间所掌握的情报，与佐助、水月和重吾一同去寻找“知道一切真相的人”。

之后大蛇丸在宇智波一族的南贺神社利用之前留下卷轴的内容将被尸鬼封尽封印的自己双手及前四代火影的灵魂放出，并利用附身在佐助身上的白绝施展秽土转生，召唤了前四代火影；自己则以白蛇形态逃离因施术而濒死的躯体，夺取了具有初代细胞的白绝身体，并且恢复了双臂。

大蛇丸一名是参考了美図垣笑颜（みずがき えがお）创作的读物《児雷也豪杰谭》里面的人物，名字就叫大蛇丸。另外的两个“三忍”的原型也是出自这个故事。故事中，主角児雷也（自来也）是一名可以召唤蛤蟆的忍者，纲手是一名善于操纵蛞蝓的公主，他们的主要敌人是擅长使用毒蛇的大蛇丸。三个角色代表“三竦”：蛞食蛇，蛇食蛙，蛙食蛞，互相吞食。

另外，大蛇丸也有可能参考日本神话中登场的八岐大蛇（Yamata-no-Orochi），一个拥有八头八尾的巨大蛇怪。在日本古书《古事记》与《日本书记》的故事中，八岐大蛇从高志而来，每年出现就要食一次人。

须佐之男因品行败坏，在高天原做尽错事，遭天神们逐出。在出云国遇到了一对老夫妇足名椎命与手名椎命，以及他们的女儿奇稻田姬，这一家正在伤心的哭诉。足名椎命与手名椎命是大山津见神的后代，他们的8个女儿有7个被一条恐怖的巨蛇吃掉，那就是八岐大蛇，如今他们仅剩这么一个女儿。

须佐之男发誓一定要退治此蛇，作为回报，要他们把女儿嫁给他。他让老夫妇备酒，然后在地上造洞，把酒分别放置于8个洞里，躲起来等八岐大蛇出现。八岐大蛇来到后闻到酒香便开始喝酒，当大蛇喝醉了之后，须佐之男趁机***死了大蛇。当他斩断蛇尾的时候发现了一把剑，这就是后来的草薙剑，是传说中的三神器之一。后来因为倭建命使用才使草薙剑名扬天下。

研究永生本来就是为了学会所有忍术，但是实现了永生之后却依然无法学会所有忍术，这对于大蛇丸来说实在是太残忍了。既然大蛇丸的永生肯定要付出某种不为人知的代价，而他的梦想又永远实现不了，那还不如活够了日子就沉醉于十拳剑的幻术世界中，或者是无限月读的虚假世界。至少，这样可以实现一次梦想。