交叉研究院有专业计算机科学与技术（计算机科学实验班），计算机科学与技术（人工智能班）。

清华大学信息工程有二个二级学院，分别是信息科学技术学院和交叉信息研究院。信息科学技术学院主要专业有电子信息科学与技术，电子信息工程，电子科学与技术，微电子科学与工程，自动化，软件工程，计算机科学与技术。