个人工资超过5000怎么扣税？超过5000纳税，是有分级的，每一个级别的纳税比例和速算扣除数都不一样。超过5000的工资纳税分级表如下：全年应纳税所得额不超过36000元的，税率为3%，速算扣除数为0;全年应纳税所得额超过36000元不超过144000元的部分，税率为10%，速算扣除数为2520;全年应纳税所得额超过144000元不超过300000元的部分，税率为20%，速算扣除数为16920;全年应纳税所得额超过300000元不超过420000元的部分，税率为25%，速算扣除数为31920;全年应纳税所得额超过420000元不超过660000元的部分，税率为30%，速算扣除数为52920;全年应纳税所得额超过660000元不超过960000元的部分，税率为35%，速算扣除数为85920;全年应纳税所得额超过960000元的部分，税率为45%，速算扣除数为181920。最后，居民个人综合所得应纳税额的计算公式应为：个人应纳税额=个人全年应纳税所得额×适用税率-速算扣除数=(全年收入额-60000元-社保、住房公积金费用-享受的专项附加扣除-享受的其他扣除)×适用税率-速算扣除数。只要算出了个人应纳税额，那么乘以相应的税率之后减去速算扣除数，就可以得到自己需要交的税了。