南京大学校徽外形采用盾形的设计风格，该风格为中央大学时期所流传下来。校徽的左下方及右下方为英文NANJING UNIVERSITY。南大校徽确定了特定色值得的紫色为标准色，并将其命名为南大紫。

校徽正中为南京市——雪松，寓意南大坚韧不拔的精神。雪松的下方为图案及1902的字样，点明南京大学的建校时间为1902年。校徽的上方中间部位为由南京的艺术字体所组合的圆形图案，其两旁各有一只金陵辟邪神兽貔貅，是南京的标志。