1、颜色不同。花椒风干后颜色呈棕红色，而麻椒原本为淡绿色，风干后呈棕黄色，二者颜色上并不同；

2、气味不同。花椒气味比较***，但也比较麻香，闻着能接受，而麻椒气味也***，但闻着很刺鼻，闻着不香反而比较臭，在四川本地也被叫做“臭花椒”；

3、口感不同。花椒口感麻辣，回味鲜香，而麻椒口感非常的麻，回味也是麻味，主要突出麻这个口感，和花椒口感不一样；

4、烹饪作用不一样。花椒在菜品中主要起着增异香和加微麻味这两种烹饪作用，而麻椒主要是给菜品增加麻味，并不能给菜品增加香味，一般用量较少，如果加多了反而会影响菜品原来的香味和口感。

5、用于菜品不一样。花椒因为气味特殊芳香，口感微麻，所以目前广泛用于各种菜品进行调味，包含川菜、湘菜、粤菜还有各类烧烤、油炸食品等重味食品当中；麻椒因为气味***且不好闻，口感也特别麻嘴，所以在菜品使用当中并不广泛，目前主要用于四川地区的川菜类中使用。