1、位置不同：南充站位于四川省南充市顺庆区铁欣路1号。南充北站位于四川省南充市顺庆区潆华北路二段。

2、列车方向不同：南充站有开往广州、沈阳、武昌、达州和成都方向的各种列车。而南充北站仅有开往成都、重庆和广州方向的列车。

3、修建时间不同：南充站1995年开工，1997年正式投入运营。南充北站始建于2014年5月22日，于2015年12月30日投入使用。

4、区域管理不同：南充站是中国铁路成都局集团有限公司遂宁工务段管辖。南充北站由中国铁路成都局集团有限公司管理。

5、主要线路不同：南充站为达成复线的车站。南充北站是兰渝铁路和达成铁路上重要的铁路车站。