培菲康可直接补充人体正常生理细菌，调整肠道菌群平衡，抑制并清除肠道中致病菌，减少肠源性毒素的产生，促进机体对营养物的消化，是益生菌制剂，一般对人体无害，可以长时间使用。

但要因为可能导致机体对其产生依赖性，或形成耐药性。一般建议使用2周左右。酸奶含益生菌成分，可以多饮用酸奶来代替，如果症状不好转，可继续药物治疗。

如果有消化系统的溃疡症状，那包括培菲康三种菌外的所有细菌都可由溃疡处进入人体血液，可能产生菌血症。

此外，有便秘者也不建议服用。