新生儿惊厥的原因可能是缺氧缺血性脑病导致，脑膜炎、脑炎、脑脓肿、败血症、破伤风等，以化脓性脑膜炎和败血症也会出现惊厥的症状。药物过量或中毒也会造成惊厥。此现象也可能是家族性良性惊厥。

1、颅内疾病：缺氧缺血性脑病：占惊厥病因的60%—70%，惊厥多见于生后24小时内； 缺氧性及产伤性颅内出血：惊厥多见于生后2—3天；脑梗塞：多为大脑中动脉梗塞、惊厥多见于生后1—4天。

2、感染：多见于脑膜炎、脑炎、脑脓肿、败血症、破伤风等，以化脓性脑膜炎和败血症为多。宫内感染的宝宝，惊厥见于生后3天内，生后感染的则多见于出生后1周后。新生儿高热惊厥罕见。

3、代谢异常：低血糖，多发生于生后3天内；低钙血症，包括惊厥发生于生后1—3天的早发型及生后1—2周的迟发型；低镁血症，常与迟发型低钙血症并存；高钙或低钠血症；维生素B6缺乏症：惊厥见于生后数小时到2周，镇静剂无效；胆红素脑病；氨基酸代谢异常：枫糖尿症、苯丙酮尿症、高甘氨酸血症等。

4、药物：药物过量或中毒：如***、氨茶碱、有机磷等。撤药综合症：孕母用***，***类药物，能透过胎盘进入胎儿，分娩后药物供应突然中断，常于生后6小时内发生惊厥，24—48小时恢复正常。

5、先天性中枢性神经系统畸形：脑积水、脑发育不全、小头畸形等。

6、家族性良性惊厥：为自限性疾病，惊厥发生于生后3天以内，发作频繁但一般情况良好，87%于数周至数月后自愈，13%发展为癫痫。

7、其他：包括红细胞增多症、半乳糖血症、高血压脑病等，或原因不明。