福建航海教育由被***赞誉为“华侨旗帜，民族光辉”的陈嘉庚先生于1920年创办，是国内历史最悠久的航海类教育的高等院校。在国内和东南亚具有广泛影响力，被誉为“中国航海家的摇篮”。1952年9月，福建私立集美水产商船专科学校与厦门大学航务专修科（即现在的集美大学航海学院）合并成立“国立福建航海专科学校”，时为新中国仅有的三所高等航海学校之一。1953年，福建航海专科学校与大连海运学院合并。1954年，在陈嘉庚的呼吁下，集美学村恢复航海教育，成立“厦门市私立集美水产航海学校”。1970年并入厦门大学，1973年又脱离厦门大学。1978年底，学校更名为“集美航海专科学校”，1989年5月更名为“集美航海学院”，时为交通部直属高校。1994年10月，集美学村原集美航海学院、厦门水产学院、福建体育学院、集美财经高等专科学校、集美师范高等专科学校五所高校合并组建为集美大学，学校更名为“集美大学航海学院”。