南京军校有中国人民解放军陆军工程大学、国防科技大学、国防大学南京政治学院、陆军炮兵防空兵学院南京校区、南京陆军指挥学院、海军指挥学院。

1、中国人民解放军陆军工程大学

中国人民解放军陆军工程大学，以中国人民解放军理工大学和中国人民解放军军械工程学院主体为基础于2019年组建。大学组建单位办学历史可追溯至上世纪30至50年代在江西宁都创办的红军无线电训练班。陆军工程大学是人才培养与科学研究并重、工程技术与作战指挥融合的教学研究型综合性大学。

2、国防科技大学

中国人民解放军国防科技大学，简称“国防科技大学”，由中国共产党中央军事委员会直属，位列第一个五年计划国家156项重点建设工程、211工程、985工程、双一流、军队“2110工程”，为中共中央1959年确定的全国20所重点大学之一、国务院首批批准有权授予硕士及博士学位的院校、全国首批试办研究生院的院校。

3、中国人民解放军南京政治学院

中国人民解放军南京政治学院，是隶属总政治部领导的任职教育院校，正军级建制，是全军院校教学优秀单位、军队“2110工程”重点建设院校、全军研究生培养单位重点建设院校。

中国人民解放军南京政治学院前身为1977年12月成立的中国人民解放军南京政治学校；1986年6月，改称中国人民解放军南京政治学院；1999年5月，空军政治学院转隶并入南京政治学院。

4、中国人民解放军南京陆军指挥学院

南京陆军指挥学院是陆军中级合成指挥院校。担负着为全军培养合成军队中级军政指挥干部、省军区系统人武指挥干部任务。学院前身是总参高级步兵学校，成立于1952年5月2日，隶属中央军委，1999年改名为南京陆军指挥学院。

5、海军指挥学院

中国人民解放军海军中级任职教育院校。前身为1952年5月成立于南京的军事学院海军系，1957年10月扩建为海军军事学院。1986年6月，改名为海军指挥学院。院址南京。主要任务是培养海军中、高级指挥军官和高层次教学、研究人员等。