两条DNA互补链反向平行；由脱氧核糖和磷酸间隔相连而成的亲水骨架在螺旋分子的外侧，而疏水的碱基对则在螺旋分子内部，碱基平面与螺旋轴垂直。

1、由两条反向平行的脱氧核苷酸长链构成双螺旋结构。

2、磷酸和脱氧核糖交替排列，在外侧构成构成骨架，碱基排列在内侧。

3、两条链的碱基间能过氢键形成碱基对，碱基对之间遵循碱基互补配对规律（A和T；G和C）。

由脱氧核糖和磷酸基通过酯键交替连接而成。主链有二条,它们似“麻花状”绕一共同轴心以右手方向盘旋,相互平行而走向相反形成双螺旋构型。主链处于螺旋的外则,这正好解释了由糖和磷酸构成的主链的亲水性。