what is it…和what it is…区别是，前者为特殊疑问句，后者为名词性从句，不能以问句形式出现。what it is 一般为句子的一部分，不单独出现。What is it 一般表达为：问这是什么 是一个单句 。

What is it 是问这个是什么 是一个单句 是可以单用的

what it is 一般在句子的一部分 比如

i am wondering what it is

I am determined my children shall be brought up in their father's religion, if they can find out what it is.一般解释为 事情的真相 理由 原因

一般是没有人直接用 waht it is