1、性质不同。鲫鱼为自然生长鱼类，鲤鲫鱼则是由中国科学院武汉水生研究所通过科学技术培育而出的新品种。

2、外观不同。鲫鱼体型较小，鱼唇较薄，背部多为青褐色，鲤鲫鱼与鲤鱼的外观相同，体型较大，鱼唇较厚，背部多为灰黑色，但脊椎骨数量与鲫鱼相同。

3、胡须不同。鲤鲫鱼最大的差别便是鲫鱼没有胡须，而鲤鲫鱼有胡须。