函证的方式主要包括以下几种：

1. 电子邮件函证：这是最常见的方式，通过电子邮件发送银行对账单或其他财务信息进行函证。这种方式方便、快捷，但需要确保电子邮件地址的有效性和安全性。

2. 纸质信函函证：银行地址明确，且信任度高的银行可能会选择发送纸质信函的方式进行函证。这种方式更传统，但需要确保信件送达。

3. 电话询证：对于一些无法通过电子邮件或邮寄方式联系的银行，可以通过电话询证。这种方式适用于规模较小或位于偏远地区的银行。

4. 信息系统函证：一些银行已采用在线信息系统进行财务管理，可以通过系统查询和确认余额。这种方式需要确保信息系统登录和操作的合法性。

在进行函证时，应确保函证的内容清晰、具体，并注明需要确认的信息，如余额、借贷情况等。同时，要确认函证的发送和接收方式是否安全、有效，防止信息泄露和财务安全风险。