方法如下：

1、如果是少量蛋白虫，用开水烫滤材即可。如果蛋白虫较多的，一定要全面清理过滤设备，把所有用过的生化棉、过滤棉进行更换；

2、用过的过滤设备都通过高锰酸钾消毒也可以消除蛋白虫；

3、全缸换水，把鱼捞出，全面擦缸，而且用高锰酸钾刷缸；

4、减少喂食，勤洗滤材，减少鱼的密度；

5、用药，可以通过肠虫清和敌百虫来治理，简单快速，可以有效的***死蛋白虫及其虫卵。