工作签证，应当由聘请或雇佣部门向当地的入国管理局提出申请，即申请入境许可。申请时必须提供聘请书、合同书、担保书等证明材料。入国管理局呈报法务省核准后，便发给一份有签证代号的《号留资格证明书》向日本驻华大使馆或领事馆申请签证。

申请日本签证通常可有两种方式：

1、由申请人在国外向日本使领事馆提出申请；

2、由旅居日本的亲友向所在地的入国管理局提出申请。

无论采取哪一种方法，最后都是经过法务省批准后，授权大使馆或领事馆签发入境签证的。