司马迁确实被施以宫刑。

具体介绍如下：

汉武帝派将军李广利率三万骑兵出酒泉抗击匈奴，同时又派李陵率五千步兵，策应李广利。当李陵率兵深入匈奴后，却遇上匈奴的主力，尽管李陵带领将士奋力抗战，终因寡不敌众，被俘而降。消息传到长安，汉武帝十分恼火，满朝文武官员趋炎附势，附和汉武帝指责李陵的罪过。但是，司马迁却站出来替李陵辩解，这就冒犯了汉武帝的逆鳞，由此被投入监狱，受了宫刑。