黑龙江重点大学有两类，一类是中央部委所属重点大学、另一类是黑龙江省属重点大学。

中央部委所署重点大学：哈尔滨工业大学哈尔滨工程大学、东北林业大学。

黑龙江省属重点大学 ：东北农业大学 、哈尔滨医科大学 、黑龙江大学 、黑龙江中医药大学 、大庆石油学院 、哈尔滨理工大学 、哈尔滨师范大学 、哈尔滨商业大学 、佳木斯大学 、齐齐哈尔大学。