秦州历史悠久，是华夏文明的主要发祥地之一。早在七千多年前，我们的祖先就繁衍生息在这片土地上。传说中的伏羲、女娲、轩辕均出生在这里，故有羲皇故里秦州区之称。据禹贡记载，夏商时期天下分九州，秦城属雍州地。春秋战国时期，秦州属县，是我国最早设立的县。

西汉时期秦城区属陇西郡、汉武帝元鼎三年设置天水郡。三国魏文帝黄初元年，分陇右置秦州，始有秦州之名。北宋时置天水郡。明朝至清朝雍正元年废成纪，秦城由秦州直接管辖。清代将秦州升为直隶州，治所在秦城。