蚌埠学院现有包括文学与新闻传播学院、外国语学院、商学院、法政与公共管理学院、体育学院、艺术与设计学院、信息工程学院、化学化工学院、数理学院、生命科学学院、机械与汽车工程学院、土木与水利工程学院、电气工程与自动化学院等14个二级学院，在2019年设立了计算机与信息工程学院。有85个本科专业和11个硕士点。学院拥有一批学科带头人。