南京被认为有阴气重的说法主要是因为以下几个原因：

1.历史背景：南京是中国历史上重要的古都之一，曾经是多个朝代的都城，同时也是二战期间日本侵华的重要战场。这些历史事件中包含了大量的悲惨和血腥，给南京留下了沉重的历史阴影，使得人们对南京产生了阴郁的印象。

2.气候环境：南京位于江苏省东南部，夏季炎热潮湿，冬季寒冷湿冷，气候变化较大。相对于其他地区，南京的气候特点可能给人以阴冷的感觉。

3.地理环境：南京地处长江流域，地势相对平坦，受到湖泊和江河的环绕。湖泊和水体会对气候产生影响，使得南京的湿度较高，空气湿润，也可能给人以阴沉的感觉。

需要注意的是，这种说法是主观感受和传统观念的一种表达，并没有科学依据。每个人对于气氛和气氛感受都有不同的敏感度，因此对于南京是否阴气重的看法也因人而异。实际上，南京也有着丰富的文化、历史和自然资源，吸引着大量的游客。