1、类别不同

一级学科是学科大类，相当于专业类。 二级学科是下面细分的小类，本科专业目录中为“专业”相当于方向，一般是有水平的学校自己开设的。

2、下设学科不同

一级学科：每大门类下设若干一级学科，下属学科为二级学科，如理学门类下设数学、物理、化学等12个一级学科。

二级学科：一级学科再下设若干二级学科，下级学科为三级学科，如数学下设基础数学、计算数学等5个二级学科。博士、硕士学位就授至二级学科，一般意义上的博硕士点数指的就是可以授予博士和硕士的二级学科的数目。

3、数量不同

一级学科是按照国家的专业目录设置的学科，数量有限；二级学科是一级学科下的分支，专业数量较多，也就是说，一个一级学科下往往有很多个二级学科。