马家浜文化遗址在距嘉兴市区7点5公里的秀城区城南街道马家浜村，于1959年春发现，当时由省文物管理委员会、省博物馆等6个单位组成考古队进行发掘，1977年11月在南京召开的长江下游新石器时代学术讨论会上确认以马家浜遗址为代表的马家浜文化是长江下游、太湖流域新石器时代早期文化代表，并正式定名。 它的发现，引起了国内外考古界的重视，认为这证明了长江流域和黄河流域同是中华民族文化起源的摇篮。此后在嘉兴地区还发掘出如罗家角遗址等十多个马家浜文化遗址，并再次引起了中外学者的关注。马家浜文化已载入《大不列颠百科全书》和1990年出版的《中国大百科全书·考古卷》，确定了它在史前文化考古中的地位。 马家浜文化遗址1989年12月公布为省级重点文物保护单位。