1、人工和机械。清除农田中的三裂叶豚草可以将秋耕和春耙同时进行。秋耕是将三裂叶豚草的种子埋在土壤10cm以下的位置，这样就能阻止三裂叶豚草种子的萌发。春季来临时，大量的三裂叶豚草长出新芽，这时可以通过春耕将大部分的三裂叶豚草幼苗铲除。

2、化学。采用化学方式将三裂叶豚草铲除，虽然短时间内你就能明显的看到三裂叶豚草有所减少，但花费的资金很多，而且大面积的使用化学除草剂还容易造成环境的污染，甚至出现植被退化，这些后果都是你无法预测的。

3、生物防治。引进三裂叶豚草的天敌豚草条纹叶甲，并繁殖于田间，豚草条纹叶甲认准一种食物后就很难再改变，只食用三裂叶豚草，食用三裂叶豚草后自然会使三裂叶豚草大幅减少。