区别：

1、面向范围不同

自主招生：全国范围的考生

三位一体综合评价：主要针对浙江的考生，2017年大部分省内高校都在内，共43所和8所外省高水平三位一体院校。

2、直接加分与间接加分

自主招生：由高校自行组织，一般由笔试、面试两部分组成。主要侧重文化成绩。通过自主招生选拔的考生必须参加高考，在高考录取时可获得直接20分或不等的优惠。

三位一体：旨在建立学业水平测试、综合素质测评和高考三位一体的多元化招生考试评价体系，从而有利于选拔适合高校培养目标的学生，有利于引导中学实施素质教育，入围考生高考后，会得到将上述三个成绩按一定比例计算形成的综合总分，并按报考院校的专业招生数量，择优录取。