1、方向和范围不同：执业西药师可以从事与西药有关的工作，执业中药师可以从事与中药有关的工作。

2、考试的科目不同：执业西药师考试科目有药事管理与法规、药学专业知识（一）、药学专业知识（二）、药学综合知识与技能；执业中药师考试科目有药事管理与法规、中药学专业知识（一）、中药学专业知识（二）、中药学综合知识与技能。

3、范围不同：中药师主要是指导中药使用，西药师是指导西药的使用。不允许跨执业范围执业。