从药用价值来讲生吃最好。熟吃，在把南瓜子加工熟的过程中，无论是煮还是炒，都需要加热，温度会破坏南瓜子的一部分营养。以下是生吃南瓜子的好处：

1、生南瓜子的热量相对较低，既能吸收南瓜子的营养同时不影响减肥，生南瓜子作为大众健康食品不仅保证了南瓜子的原汁原味。

2、生吃南瓜子对人体更容易吸收其磷质，这样可以有效防止矿物质在人的尿道系统凝结，达到预防肾结石的目的，还可以促进已有结石的排出。

3、生吃南瓜子还可以治疗早泻、尿频等病状，如果当作药物使用生吃南瓜子才能更好地发挥南瓜子的营养价值和功效。