台湾的清华大学是後来才在台湾省新竹市成立,所以又称新竹清华大学.
国立清华大学:位於新竹市东区,清大是中华民国***後来在台湾新竹市复校,与北京清华大学是系出同源,校区一旁就是国立交通大学,两校在校内有清交小径可互通.专业偏重理工,只有少数的文商专业,整体来说在台湾理工科系可排第二,但计算机科学专业都不如隔壁的国立交通大学.在2010年上海交大的世界大学学术排名中,综合排名为世界 314,各领域世界排名为工程/技术与计算机科学(工科)76-100,学科排名则为化学76-100.另外,清大与国立交通大学、国立中央大学与国立阳明大学共同组成台湾联合大学系统,可彼此跨校互选课程及共享图书资源.迈向顶尖大学计画(新一期五年五百亿)执行期间自2011年起至2015年止,每年获得12亿台币.