土壤污染的主要来源有有机污染源头、放射性元素污染源头、重金属污染源头等等。

有机污染源头：土壤的有机污染物主要是化学农药。化学农药中有很多种物质，如富含机磷农药、苯氧羧酸类、苯酚等等。因为农药的一些不合理的使用导致了土壤出现了农药的残留，从而带来了严重的污染。

放射性元素污染源头：主要来源于大气层的核试验的沉降物，和原子能和平使用种产生的废气、废水等物质。这些含有放射性元素的物质会因为沉降或雨水的冲刷导致污染土壤。

重金属污染源头：含有重金属的废水灌溉土壤和一些企业的废气沉降入土壤中，能够被生物富集，从而对人类造成影响。