工程院院士和科学院院士的性质、方向、特点不同。前者是工程科学技术方面最高的学术称号，而科学院院士是科学技术方面最高的学术称号。工程院院士主要是依靠重点理工科大学和大量的时间而成为的科学家会专家。科学院院士主要是依靠重点综合大学和大师的熏陶。

工程院类似于俱乐部性质，分散在全国各地以及各个不同的单位都会有；而科学院虽然也是各地都有，但是研究的东西都是特定的一个方向。两者间的方向是不一样的，工程院院士主要是从事实践方面的东西，一点点实验出来。科学院院士主要是研发理论方面的东西。