建文帝生前有两个儿子。

长子朱文奎：建文帝朱允炆长子，母皇后马氏。生于南京，祖籍安徽凤阳。洪武二十九年十月晦日，据说朱文奎出生后，太祖朱元璋说："日月皆终，大凶之象。"所以很不高兴。建文元年，立为皇太子。建文四年，明成祖朱棣攻入南京之后，与其父朱允炆一起失踪。

次子朱文圭：生于应天即南京，祖籍南直隶凤阳府，明惠帝次子，母皇后马氏。建文四年，明成祖朱棣以"清君侧"为名，率兵攻破南京金川门，占领南京，结束历时三年的靖难之役。攻克南京时，朱文圭之父朱允炆、兄朱文奎不知所终，母马皇后