字义不同。以：用，拿，把，将；依然，顺，按照；因为；在，于（指时日）；目的在于；文言连词，与“而”用法相同。已：止，罢了；表示过去；后来，过了一些时间，不多时；太，过。

出处不同

以：凡师能左右之曰以。——《左传·僖公二十六年》

白话释义：只要老师都能左右他的用意。

已：是亦不可以已乎——《孟子·告子上》

白话释义：这种做法不也是可以停止了吗？

字源解说不同

以：文言版《说文解字》：以，用也，从反巳。贾侍中说，巳，意巳实也。象形。

白话版《说文解字》：以，使用。字形采取反写“已”的方法来造字。贾侍中说，已，表示想法已落实。是个象形字。