氢键不是非共价键，而是共价键，氢键的键能小于共价键，氢键的本质是强极性键上的氢核与电负性很大的、含孤电子对并带有部分负电荷的原子之间的静电作用力。

氢键不同于范德华力，它具有饱和性和方向性。由于氢原子特别小而原子A和B比较大，所以A-H中的氢原子只能和一个B原子结合形成氢键。同时由于负离子之间的相互排斥，另一个电负性大的原子就难于再接近氢原子，这就是氢键的饱和性。