官渡区辖4个街道、3个镇、3个乡，其中1个民族乡：关上街道、太和街道、东站街道、金马街道、小板桥镇、官渡镇、大板桥镇、阿拉彝族乡、矣六乡、六甲乡，

1956年10月19日，经云南省人民委员会批准，昆明市人民委员会将原第五区、六区合并为官渡区；

1958年12月，龙泉区并入官渡区；

1961年小哨片区由嵩明县成建制划归官渡区；

2004年，国务院批准调整昆明市市辖区行政区划：调整昆明市五华区、盘龙区、官渡区、西山区的行政区划；

2006年，撤销小哨乡，其行政区域并入大板桥镇，调整后，官渡区辖关上、金马、东站、太和4个街道办事处，大板桥、小板桥、官渡3个镇，矣六、六甲2个乡和阿拉彝族乡。