支付宝查询医保余额可以通过以下两种方式查询：

1、打开支付宝app，搜索【市民中心】，点击【社保】-【社保查询】即可查询。

2、打开支付宝app，搜索【市民中心】，点击【医保】即可查询。

需要注意的是，目前查询医保余额服务是由当地社保/医保机构提供的，目前仅支持部分城市，如果无法找到此入口说明所在城市暂未接入。