1、导航系统技术原理区别：一类卫星导航系统是采用多普勒测速原理，即利用测量导航信号的多普勒频移来求出距离变化率进行导航定位，但由于这种方式存在不能连续实时导航等一些缺点，所以采用这种原理的卫星导航现已基本没有了。

另一类卫星导航系统采用时间测距原理，即利用测量导航信号传播时间来求出距离进行导航定位，目前大多数卫星导航系统都采用这种方式，包括三代北斗导航卫星，但即使这样，它们仍各不相同。

2、导航覆盖范围区别：根据导航卫星的信号覆盖范围，卫星导航系统还可分为区域性卫星导航系统和全球性卫星导航系统，我国的北斗一号、二号卫星导航系统以及日本、印度的卫星导航系统等属于前者，美国、俄罗斯、欧洲和我国的北斗三号卫星导航系统属于后者。

3、导航卫星轨道不同：导航卫星还可根据卫星的轨道高度，分成近地轨道、地球中圆轨道、倾斜地球同步轨道和地球静止轨道导航卫星几种。我国北斗一号为地球静止轨道导航卫星，而北斗二号和三号导航星座都由地球中圆轨道导航卫星、倾斜地球同步轨道导航卫星和地球静止轨道导航卫星组成。目前，美国、俄罗斯和欧洲的导航卫星都运行在地球中圆轨道，印度和日本的导航卫星星座均由倾斜地球同步轨道导航卫星和地球静止轨道导航卫星组成。