科研纵向和横向主要的区别是所表示的对象不同，内容也不同，横向课题是指企业的课题，而纵向课题是指有各级***指定的科研行政单位代表***立项的课题。纵向课题包括国家级课题，一般指国家科学技术部、国家发展和改革委员会、国家财政部、国家自然科学基金委员会、国家社会科学基金委员会下达的项目。